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農村衛生防疫工作作為新農村建設的一個重要方面越來越受到高度的重視。然而就目前而言，我國的農村公共衛生防控體系還比較脆弱，極有可能為艾滋病、非典、人禽流感等新發傳染病以及結核病、血吸蟲病、瘧疾等傳染病疫情的暴發流行埋下嚴重隱患。

農村公共衛生是全國公共衛生防控體系的重要組成部分，其主要工作是由鄉村防疫醫生承擔的，他們肩負有包括傳染病的發現與報告，兒童計劃免疫，艾滋病、結核病、瘧疾等傳染病的規范管理和督導服藥以及傳染病健康教育等疾病預防與控制工作，工作繁重，責任重大。

但農工黨安徽省委通過對安徽省一些農村調研后發現：目前，全省乃至全國的大多數鄉村防疫醫生都不被列入事業編制，不發固定工資，只能通過有償服務進行創收來養家糊口，沒有最基本的收入保障。在任務重、收入低的情況下，鄉村防疫醫生普遍感到衛生服務力不從心，因此部分鄉村防疫醫生自己單干或開個體診所，或是外出打工，造成人才流失嚴重。鄉村防疫醫生通過有償服務進行創收極易發生公共衛生危險，如2005年發生的“安徽泗縣乙肝疫苗超范圍接種”事件就與此有關。這種情況極可能導致發生傳染病疫情后，醫生為了多掙錢而隱瞞報告，從而使得一些傳染性疾病的早期診斷治療與及時隔離處理受到極大影響，造成傳染病的蔓延或暴發流行。正是由于鄉村防疫醫生收入沒有保障，致使部分人員的工作積極性和責任心受到極大影響，公共衛生功能衰弱，某些已經消滅或已被控制的傳染病、寄生蟲病、地方病在一些地方有所回升，部分新發傳染病也時有發生和流行。

為農民提供基本而有保障的公共產品，有利于推進城鄉協調發展，也有利于黨的農村基本政策與改革發展的進程相適應。因此農村公共衛生事業的發展應主要靠政府財政支持，而決不能簡單市場化。為此建議，解決鄉村防疫醫生的待遇問題應像解決農村“民辦教師”一樣，將鄉村防疫醫生的工資納入財政支出，由政府發放工資。